海底神殿在水下，玩家想去往水下首先要解决呼吸问题，有三种方式可以选择，第一种是成本最低的方式，只需要准备一定数量的门，在没有氧气时找到一个安全角落放置。第二种方式是使用水肺药水，准备好一个酿造台放置三瓶普通的水，然后加入下界疣将水瓶给它转化成粗制的药水，再加入河豚将粗制药水转化成水肺药水，最后加入红石能在水下呼吸八分钟的时间。喝下药水后能获得一个水下呼吸的状态效果，持有这个状态效果时在水下移动不会消耗氧气条了。
最后一种方式需要合成潮涌核心，合成方式是在工作台中间摆上一个海洋之心，四周一圈摆上八个鹦鹉螺壳就能合成，此时到海底神殿周围准备好海晶灯或者海晶石搭建出来就行。跟海底神殿的距离不要太远或太近，太远会出现覆盖不全的情况，太近则会受到守卫者的攻击，搭建完成后会有潮涌能量的状态效果，这个状态效果能为受影响的玩家提供水下呼吸、夜市以及急迫三合一的效果，前提条件是玩家必须接触到水。海底神殿有守卫者和远古守卫者两种敌对的水生生物，远古守卫者会生成在海底神殿的内部构造中。
每一个海底神殿会固定刷新三个远古守卫者，生成位置分别是中间和左右两侧，如果海底神殿里面有远古守卫者会给玩家施加挖掘疲劳状态效果。屏幕上出现了远古守卫者的图标就说明已经被施加该效果了，此时挖掘方块速度会变得很慢。远古守卫者拥有八十点血量，困难模式下的伤害为七点五，而且造成的是魔法伤害，也就是说穿戴的盔甲无法防御，同时还有一段普通伤害，普通伤害的数值要比魔法伤害高一点。
不论是远古守卫者还是普通守卫者，它们的攻击方式都是发射一束持续性的激光，激光并不是瞬发伤害，必须锁定玩家一段时间后才能释放造成伤害。锁定期间如果被锁定的生物离开了它的攻击范围，或者前方有方块阻挡，它这边会直接中断锁定而且不会造成任何伤害。如果攻击造成伤害的话会按照先后顺序造成两次伤害，第一次为魔法伤害，第二次为普通伤害。远古守卫者和普通守卫者还有个攻击方式是尖刺，每次近战攻击远古守卫者时都会受到两点伤害。
